1952 :  A l'initiative du Ministère de l'Agriculture, des aviculteurs se regroupent dans une structure technique : le Syndicat National des Aviculteurs Agréés (SNAA), afin de promouvoir une amélioration quantitative de leurs productions, et de progresser en zootechnie, génétique et conditions sanitaires.

1979 : Le SNAA affirme sa vocation de Recherche et Développement en apportant un appui technique aux entreprises de sélection, transférant ses services techniques, il devient le SYSAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles Français), élargissant progressivement son champ d'action à toutes les espèces avicoles.

1990 : Audit des potentialités pour la mise en œuvre de programmes rationnels  de sélection génétiques chez la truite arc-en-ciel à la demande du ministère de l'agriculture  (dpe) en concertation avec l'Inra

1991 : Sollicité par la profession aquacole, l'INRA et les pouvoirs publics qui souhaitent voir s'organiser l'amélioration génétique en production de salmonidés d'eau douce, le SYSAF crée une section aquacole, devenant alors le SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français).

1993 : A la demande de différentes entreprises d'écloseries marines, le SYSAAF ouvre ses services à la pisciculture marine, avec l'aval du Ministère de l'agriculture et de la pêche, et en instaurant une collaboration étroite avec l'IFREMER.

1996 : Mise en place d'un logiciel de traitement des données génétiques, INFAVI

2001 : A la demande des écloseries de mollusques et de coquillages dont la production se développe fortement, le SYSAAF élargit à nouveau son champ d'activité avec plusieurs espèces conchylicoles.

2003 : Création du logiciel informatique de traitement génétique spécifique aux espèces aquacoles, INFAQUA

2008 : Appui à la sélection en vue de restauration écologique d'espèces sauvages, comme l'esturgeon et le saumon.

2011 : Le SYSAAF élargit son champ d'activité aux crevettes.

2013 : Création d'une cryobanque nationale pour les espèces aquacoles en partenariat avec l'INRAE, l'IFREMER et la Cryobanque.

2015 : Arrivée de la sélection génomique et création de la plateforme Fortior Genetics, qui permet réaliser des challenges à des pathogènes pour améliorer la résistance aux maladies chez les poissons en partenariat avec l'ANSES

2019 : Suite à la sollicitation de différentes entreprises, le SYSAAF élargit son activité aux insectes, avec la mouche soldat noire. Création de la plateforme SpecGen en partenariat avec le CNRS et la plateforme SIR de l'Université Rennes-1 qui permet de travailler sur les phénotypes de nouveaux caractères d'intérêts.

2021 : Arrivée du Machine Learning