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Dernière mise à jour : Mai 2018

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Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français

QualityHuître

2019 – 2022 ( 3 ans) Espèces concernées : Huître creuse (Crassostrea gigas)

QualityHuître
Sélection génomique pour l’amélioration de la qualité de l’huître. Thèse d'Antoine Jourdan.

La sélection génomique révolutionne la gestion des populations d’élevage depuis 15 ans. En aquaculture, elle commence à être utilisée chez le saumon, la truite, le bar ou la daurade. En utilisant un outil de génotypage à 42.000 SNP pour l’huître creuse, espèce majeure de la conchyliculture française avec des phénotypes d’intérêt commercial comme la qualité, la croissance, la résistance aux maladies, il est désormais possible d’explorer le déterminisme génomique de ces caractères et de tester les schémas de sélection génomique chez cette espèce.

La thèse se développera autour de trois points :

  • Caractériser l’architecture génétique des caractères d’intérêt, dans des populations commerciales et expérimentales
  • Proposer des modèles d’évaluation génomique adaptés et évaluer leur efficacité
  • Evaluer la pertinence et optimiser l’utilisation de marqueurs SNPs pour la conduite de schémas de sélection conchylicoles

Objectifs scientifiques :

  • Utiliser des nouvelles méthodes de phénotypage :
    • IRM comme prédicteur du sexe (validation d’une technique déjà existante)
    • IRM comme prédicteur du rendement en chair
    • Spectro (NIR ; Raman) pour la mesure des teneurs en lipides, protéines et glycogène
  • Valider l'intérêt de la génomique pour la sélection ostréicole, sur ces caractères (et les caractères classiques)

Rôles du SYSAAF :

  • Coordinateur du projet
  • Organisation des chantiers de mesure
  • Co encadrement avec l’Ifremer d’un(e) doctorant(e) CIFRE pour l’analyse des résultats

Développements attendus pour les adhérents SYSAAF :

  • Étude sur la possibilité de sélection sur de nouveaux caractères
  • Évaluation des potentialités de la sélection génomique chez l’huître

Voir aussi

Partenaires:

Financeurs :

  • FEAMP 2018 mesure 47
    france agrimer
    UE
  • CIFRE
    cifre