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Le SYSAAF a pour objectif, par le moyen de R&D interne et de programmes de recherche, de proposer à ses adhérents la meilleure utilisation possible de la génomique dans leurs populations. Le SYSAAF accompagne ses adhérents et ses clients afin de mettre en œuvre les méthodes de sélection les plus performantes et les plus adaptées à leurs besoins comme :

• l’assignation de parentés,
• la quantification de taux d’hybridation,
• l’estimation de la diversité génétique,
• la détection de gènes ou de marqueurs près de gènes d’intérêt (ex : sexe chez la perche ou les esturgeons, résistance au virus VNN chez le bar) désirables ou indésirables,
• et la sélection génomique sans ou avec imputation.