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PinctAssign

Mise au point d’un panel de marqueurs génétiques pour établir le pédigrée des huîtres à lèvre noire en écloserie commerciale (2023-2025)

Contexte :

  • La Polynésie projette le développement d’écloseries et de programmes de sélection pour sécuriser et améliorer l’efficacité économique et écologique de la perliculture.
  • La collecte de naissain d’origine sauvage est de plus en plus dépendante de facteurs environnementaux comme l’intensité incontrôlable du phénomène El Niño.
  • La production repose sur peu d’atolls capteurs pouvant fragiliser cette dernière.
  • L’amélioration de la qualité (forme, couleur, lustre, orient, défauts) constitue une priorité pour réduire le nombre d’huîtres greffées et promouvoir l’originalité de la perle noire de Polynésie face aux productions d’autres espèces concurrentes en Australie ou en Asie.  

Objectifs scientifiques :

  • Le projet PinctAssign vise à développer un panel de marqueurs génétiques pour établir le pédigrée des animaux produits en écloseries afin d’évaluer les risques de perte de variabilité génétique, proposer des optimisations de la gestion de la variabilité génétique en écloseries et estimer l’influence des parents sur  les performances recherchées.
  • Le projet soutenue par la Direction des Ressources Marines (DRM) associe le SYSAAF, l’IFREMER et l’entreprise Regahiga pearls (Les Gambier, Mangareva).

Rôles du SYSAAF :

  • Coordination du projet
  • Interaction avec l’entreprise Regahiga pour mettre à disposition des échantillons et des données de performances enregistrées sur 2 cohortes de production. Les animaux seront génotypés sur la puce 72 000 marqueurs SNP développée antérieurement par Ifremer avec l’appui en particulier de la DRM.
  • Analyse en partenariat avec Ifremer des génotypes pour définir les marqueurs d’intérêt, établir les pedigrées, estimer les indicateurs génétiques de conservation de la variabilité génétique.

Développements attendus

  • Présentation des résultats à la filière Polynésienne.
  • Transfert et automatisation de panels à un laboratoire de génotypage pour les écloseries Polynésiennes.

Date de modification : 05 avril 2024 | Date de création : 05 avril 2024 | Rédaction : SYSAAF