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Ce projet européen vise à utiliser les récents développements des techniques « –omiques » afin de revoir et d’optimiser les schémas classiques d’amélioration génétique chez la poule et le porc.

Ce travail s’articule autour de trois points principaux :

1. Identifier des mécanismes biologiques influençant la variabilité des caractères de production,
2. Améliorer les stratégies de sélection par l’incorporation de nouveaux facteurs génétiques et non-génétiques,
3. Proposer de nouvelles stratégies de gestion de la diversité génétique et épigénétique.

Différents aspects seront couverts par le SYSAAF à l’intérieur du work-package III du projet. Ainsi, le SYSAAF participera à l’élaboration d’un questionnaire visant à dresser l’état des lieux de la gestion génétique des races locales de poules à l’échelle européenne.

La plateforme SpecGen sera mise à contribution dans le cadre du développement d’un outil faisant appel à la spectroscopie proche infrarouge pour prédire la composition lipidique du jaune d’œuf. Les résultats obtenus sur la gestion génétique in situ de la race Noire de Challans seront valorisés à l’intérieur de GEroNIMO.

Le SYSAAF co-encadrera une thèse CIFRE avec l’INRAE visant à croiser les patrons de diversité génétique et épigénétique rencontrés chez les races locales.

Les retombées du projet

• Ce projet permettra d’identifier les besoins et les interlocuteurs de la gestion de la diversité génétique des races locales,
• Les outils développés pourront être mis en place chez n’importe quelle race locale ou commerciale,
• De plus, la diversité épigénétique sera un thème abordé directement pour la première fois au SYSAAF.

Les missions du SYSAAF

• Diffusion du questionnaire,
• Récolte d’échantillons pour la spectroscopie et l’étude de la diversité (épi-)génétique,
• Construction d’une méthode de gestion génétique in situ d’une race locale,
• Co-encadrement d’une thèse CIFRE sur l’étude de la diversité (épi-)génétique.